|诺奖得主给复旦本科生上课( 二 )

如何加快发展计算生物学
据了解，莱维特今年3月来沪后的主要工作，是指导复旦团队研究计算生物学。目前，复旦大学复杂体系多尺度研究院研发的“作品折叠”（OPUS-Fold）软件，在蛋白质侧链结构预测精度上超越了“阿尔法折叠2” ，相关论文将发表在英国《生物信息学简报》上。马剑鹏介绍，以蛋白质为靶点的药物分子大多与侧链发生作用，只有获得高精度的侧链结构，才可能设计出药物分子，所以这一突破对新药研发具有重要意义。
不过，从整个系统来看， “阿尔法折叠2”仍处于全球领先地位。深度思维首席执行官德米斯·哈萨比斯近日宣布，公司与欧洲生物信息学研究所合作建立蛋白质结构数据库，提供35万种以上蛋白质结构的数据访问权限。深度思维计划将数据库扩大至1亿种以上蛋白质的结构，覆盖人类已知的几乎所有蛋白质。
“阿尔法折叠2”让计算生物学驶入了快车道，很多科研团队在开发这类软件。今年7月，华盛顿大学团队在《科学》杂志发表论文，介绍了开源软件“罗塞塔折叠”（RoseTTAFold），它不仅能预测蛋白质结构，还能预测多种蛋白质的结合形式。 8月，斯坦福大学团队发表《科学》封面论文，介绍了人工智能算法预测RNA（核糖核酸）三维结构的突破性进展。
【|诺奖得主给复旦本科生上课】很多科学家认为，蛋白质结构的精准预测是一场科技革命，将引发生物医药、新材料等产业变革。上海交通大学Med-X研究院副院长殷卫海说：“从预测蛋白质结构、寻找药物靶点到药物分子设计，再到临床试验设计，人工智能正在全面进入医药行业，开始发挥关键作用。 ”科学家还能利用人工智能软件研发新材料，如设计出自然界不存在的蛋白质材料，用于化工、能源、环保等行业。